Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms