Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.8 ms