Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms