Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms