Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.7 ms