Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ROPN1LQ96C74 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ROPN1LQ96C74 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ROPN1LQ96C74 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms