Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EDAQ92838 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms