Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF4Q8WV16 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms