Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms