Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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