Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TTC21AQ8NDW8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TTC21AQ8NDW8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TTC21AQ8NDW8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC21AQ8NDW8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TTC21AQ8NDW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTC21AQ8NDW8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTC21AQ8NDW8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTC21AQ8NDW8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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