Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARRDC4Q8NCT1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms