Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM71DQ8N9W8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM71DQ8N9W8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM71DQ8N9W8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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