Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms