Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms