Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LRRC28Q86X40 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRC28Q86X40 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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