Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSK4Q6SA08 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms