Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED8Q6PL24 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED8Q6PL24 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms