Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms