Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms