Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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