Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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