Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MORC2-AS1-201ENST00000422995 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL359547.1-201ENST00000419168 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms