Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms