Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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