Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TTLL9Q3SXZ7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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TTLL9Q3SXZ7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TTLL9Q3SXZ7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TTLL9Q3SXZ7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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