Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms