Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms