Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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