Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms