Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms