Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms