Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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GABRA6Q16445 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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GABRA6Q16445 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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GABRA6Q16445 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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GABRA6Q16445 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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