Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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