Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SURF2Q15527 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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SURF2Q15527 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SURF2Q15527 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SURF2Q15527 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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