Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms