Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms