Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms