Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms