Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CBFBQ13951 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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