Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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