Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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