Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCGQ13326 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
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SGCGQ13326 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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SGCGQ13326 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCGQ13326 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCGQ13326 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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