Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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