Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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TRAF1Q13077 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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