Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ANK3Q12955 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms