Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms