Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms