Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms