Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLEQ07864 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLEQ07864 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms